為了合理有效地處理微生物實驗廢棄物，避免環境污染和廢棄物對人體的傷害，保護實驗者的安全，制定該微生物實驗室廢棄物管理制度。
1.廢棄物是指要廢棄的所有物品。廢棄物處理的首要原則是所有潛在生物危害的材料必須在實驗室內清除污染、高壓滅菌或焚燒。
2.一般固體廢棄物如果沒有回收價值，可以直接扔進垃圾箱。
3.一般的液體廢棄物如果沒有回收價值，沒有可燃性揮發物，可以直接通過下水道排出。
4.操作有潛在生物危害的廢棄物時，必須戴手套、口罩和防護服。
5. 所有收集有潛在生物危害的廢棄物的容器都應有“生物危害”標志。
6. 所有廢棄物塑料袋或容器中盛裝的廢棄物不應超過總容量的3/4。
7.液體性有潛在生物危害的廢棄物，必須確保容器無泄漏。
8.對于多種成分混合的廢棄物，必須根據危害等級高的人來處理。
9.有潛在生物危害的廢棄物在丟棄前需要消毒。消毒方法以高壓蒸汽滅菌為優先，其次是200分鐘mg/L有效氯消毒液浸泡消毒。
10.每天有潛在生物危害的廢棄物、設備和玻璃容器用高壓蒸汽滅菌去除污染。處理過程應保證在121℃進行，時間為20-30分鐘。
11.任何高壓滅菌后重復使用的玻璃器皿都不能提前清洗，任何必要的清洗、修復都必須在高壓滅菌或消毒后進行。
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