養殖糞便經過沼氣處理或氧化塘處理后的肥水澆灌農田，同時開展利用過剩廢棄物生產有機肥，配套污水處理設施等，通過畜禽糞便和廢棄物的資源化利用，實現畜禽廢棄物資源化利用和達標排放。根據養殖場的清糞工藝、配套農田面積等，因地制宜選擇一種或幾種循環利用模式。
一是種養一體化模式：針對周邊配套農田、山地、果林或茶園充足的養殖場，養殖糞便經過沼氣處理或氧化塘處理后的肥水澆灌農田，通過畜禽糞便和廢棄物的資源化利用，實現糞便污水 “零”排放。建設內容主要包括糞水貯存處理相結合的氧化塘或沼液貯存池、肥水或沼液輸送設備、田間貯存池、配水池、肥水田間利用管網與配套設施，配置提升泵、流量計等。
二是三改兩分再利用模式：采用“三改兩分再利用”技術，即改水沖清糞或人工干清糞為漏縫地板下刮糞板清糞、改無限用水為控制用水、改明溝排污為暗道排污，固液分離、雨污分離，畜禽糞便經過高溫堆肥無害化處理后生產有機肥、養殖廢水經過氧化塘等處理后為肥水澆灌農田，建設內容主要包括改造雨污分離管道系統，購置糞便機械清糞設備、固液分離設備、固體糞便強制通風好氧堆肥系統、氧化塘處理貯存一體化設施、肥水輸送設備，建設肥水田間貯存池、管網等農田利用配套設施。
三是污水深度處理模式：采用污水深度處理技術，通過高效厭氧和好氧相結合的工藝，提高養殖廢水處理效果，實現污水達標排放。主要建設內容包括：集水池、預處理池、高效厭氧發酵池、好氧處理池、多級生物凈化塘、消毒池、膜生物反應池等基礎設施，污水泵、固液分離機、曝氣裝置和自控裝置等配套設備。
四是養殖密集區廢棄物集中處理模式。采用糞車轉運-機械攪拌堆肥-堆制腐熟-粉碎-有機肥的固體糞便處理工藝，提高肥料附加值；采用養殖場戶污水暫存-吸糞車收集轉運-固液分離-高效生物處理-肥水貯存-農田綜合利用的污水處理工藝，提高處理效率、實現污水的資源化利用。建設內容主要包括：養殖場糞污原地收集貯存設施、固體糞便集中堆肥車間及加工設施、污水高效生物處理設施和肥水利用設施等，以及糞污轉運、糞便處理和污水處理等配套設備。